マーチャットの稼働ボタンをOFFにしているときも、システム利用料は掛かりますか？

掛かりません。

OFF状態にしていただければ、ポイントが消費されることはありません。
たとえば、リクルート目的でMarchatをご利用頂く場合、求職者の就職活動期間のみONにしていただき、それ以外の期間はOFFという使い方もできます。